《新撰组镇魂歌 二分之一》是改编自梅村真也原作、桥本英治作画的漫画《新撰组镇魂歌》外传作品。

他为了能够死亡，选择了侦探之路……时值2030年代。聚集于谜之侦探·明智小五郎身边的「少年侦探团」，他们凭借着自己的行动力，解决了许多大大小小的事件。某一日，成员之一的花崎健介与谜之少年·小林芳雄相遇了。由于「不明雾霭」而成为了“死不了”体质的小林，渴望着自身的死亡，拒绝着与他人的接触。对着这样的小林抱有了兴趣的花崎，向小林提案「加入『少年侦探团』吗」。小林与花崎，他们的相遇终是与世纪罪犯·怪人二十面相和明智小五郎之间的因缘相缠结，他们两人的命运就此转动…

【本片翻译由澄空学园字幕组提供】故事是讲述一名普通的高中二年级生五河士道，突然在某一天遇上了一场大爆炸，而在这场大爆炸之中竟然出现一名身穿盔甲手持大剑的神秘美少女。原来这名少女的真正身份是“精灵”，是会给世界带来毁灭性灾难的存在，她的再次出现，将会给地球带来毁灭性的未来！然而主人公士道却有方法阻止世界毁灭，这个唯一能够阻止世界毁灭的方法就是——要与她约会！

因为在风祭流传着未确认生物的情报，以及超自然的现象之类的似真非真的传闻。瑚太朗向超自然研究会的部长，千里朱音的求助，于是展开了涉及到瑚太朗认识的学生们的调查。对于瑚太朗来说，原本只是抱着一点冒险心态而已。只要能和热闹的伙伴们一起度过的话，这样就足够了。但瑚太朗还没有注意到，他将要探求那无人知晓的“真实”。

宇宙世纪 0079 年，SIDE 3「吉翁公国」正式对地球联邦政府宣战后将近一年时，在原本太空殖民卫星 SIDE 4「姆亚」的遗址「雷霆宙域」，一心想要夺回故土联邦军「姆亚同胞团」的「伊欧.弗莱明」少尉，与由战中失去肢体的吉翁军人所组成的实验狙击手部队「活死人师」的「戴瑞.罗伦兹」上士，各自怀着不同的目的与想法，爆发了激烈的攻防战……。

　　这里是人、神、魔等种族共同生活的神秘世界，密斯塔尔希亚。过去，黑银之翼的巴哈姆特曾几乎令这个世界毁灭，但人，神，魔三族共同战斗，作出了巨大的牺牲后，终于把它的力量封印了起来。接着，神与魔两方分别保存着封印钥匙的一半。二千年以后，世界始终和平安宁。　不知从什么时候起，人类将巴哈姆特当作了独一无二的尊贵存在，畏惧并崇拜它。某一天，一位少女夺走了保护严密的神族的钥匙。世界的均衡渐渐被打破。当巴哈姆特再次发出吼声之时，世界再次落入绝望的深渊。世界啊，毁灭吧！某个声音如此肯求着。

南波刑务所——位于海上孤岛的难攻不落巨大刑务所。没有任何人能从被强悍的看守以及世界最高水准的安保所守卫的这所刑务所当中逃脱……应该是这样！？带着神秘枷锁的天才越狱囚犯·Jugo（囚犯编号15号）、喜欢女人的赌徒·Uno（囚犯编号11号）、爱打架的美食家·Rock（囚犯编号69号）、身患宿疾的阿宅·Nico（囚犯编号25号）。集中在13舍13房的，有些奇怪的4名囚犯。为了阻止他们越狱，每天急速冲刺的最强看守双六一！！个性丰富的囚犯、看守们的最高纯粹笨蛋物语，在此刑务所开幕！！

1918年，早春惊蛰，杭州留下镇的夜空电闪雷鸣，大雨倾盆。王好急得像热锅上的蚂蚁，老婆即将临盆，老大老二去接产婆至今未回。突然，内房传出初生婴儿清亮的啼声。兄弟带着骨头被颠散的产婆回到王家村时，他们的么妹秋霜已经等不及降生了。产婆这一耽误，孩子的娘差点儿血崩丢了性命！在檐下避雨的瞎子听到孕妇差差点儿血崩，逮着机会触霉头，说天降邪星，小秋霜命中带煞，谁沾了她霉一辈子。

独自居住在东京旧市街的17岁职业将棋棋士——桐山零。他是个幼时就因为意外失去家人，怀抱着深沉孤独的少年。出现在这样的他面前的，是明里、日向、桃三姐妹。与她们的相处后，零开始发生些许改变——。

与TV版第24话和剧场版紧密联系的完全新作「飞往未来的翅膀」。