在电视台工作的主人公三村修治（织田裕二 饰）在被宣布身患绝症之后，在生命的最后时间里，为妻子（吉田羊 饰）的幸福考虑，寻找可以将之托付的男人...

日向葵海（名城美和 饰）和长谷川陆（坂口健太郎 饰）是青梅竹马的好友，两人同朋友松田直哉（龙星凉 饰）和中村铁太（泉泽佑希 饰）一起组建了一支乐队。直哉一直默默喜欢着葵海，他决定在夏日祭上表白自己的心意。然而，葵海的目光却一直追随着冷傲孤僻的陆，在他的温柔和冷漠之中，葵海无法确定自己在他的心中究竟存在于怎样的位置。夏日祭当天，乐队登台演出，心不在焉的葵海在搞砸了整场演出之后死于交通意外。然而当她再度睁开双眼，发现自己竟然回到了一周之前...

孙平夫妇有一子名小宝，孙妻百般溺爱，孙平又不能以身作则，因而对小宝的教育收效甚微。邻居蒋福根有一子阿龙，蒋对孩子动辄打骂，蒋母又对孙子一味袒护。由于家庭教育不当，小宝、阿龙打架、逃学、偷窃财物、离家出走。在学校和社会的帮助下，孩子认识错误，走上正路，家长们也从中吸取了教训。

经验值一级的牛头人哀木涕（奶茶 配音）怀抱着勇斗一百级恶龙的英雄梦，却时时遭受被抓去“炖土豆”的威胁。他和同样初级的小伙伴傻馒（YOYO 配音）、劣人（CBI 配音）意外获得了一本名叫《山口山战记》的宝书，拯救世界的重任落在了他的肩上，斗恶龙从梦想变成了现实。虽然跌跌撞撞，哀木涕和小伙伴们还是勇敢踏上了成长之路。

专针对警察的连续杀人案件发生了，警察内部引起巨大的回响。对于想得到案件情报的小五郎，目暮警部却意外地守口如瓶。看到如此情况的柯南，联想到事情可能和警察部有莫大的关系。然后，下一个被枪击的目标居然是佐藤刑警!刚巧在案发现埸出现的小兰受到案件的刺激而被弄至失忆!犯人为了杀人灭口，于是企图把唯一的目击证人杀害!深知情况严重的柯南，为了保护小兰，不惜孤身犯险去把犯人找出来!

有一天众多企业在米花市政大楼，共同进行了一种新的游戏“茧”的成果发表会。玩家可透过这个游戏，进入虚拟世界中，体验实地游玩游戏的快感。r但是在这个同时，汤玛斯辛多拉董事长基于某些动机，杀害了工藤优作的朋友樫村忠彬，后来被揭发罪行。r在另外一边正式启动的“茧”，被泽田弘树所开发的诺亚方舟程式入侵，使整个游戏变成了一场生存游戏。眼看着未出局的人数越来越少，柯南如何挽救50个人的性命呢？......

发生多起音乐家被暗杀的连续杀人事件。r被杀害的被害人，都是著名钢琴家所带领的音乐学院毕业生。r而他一手创立的音乐厅落成启用，首次特地举办音乐会特别邀请柯南一行人担任与会嘉宾。音乐会的焦点在于巴哈所弹奏的管风琴以及世界著名的小提琴“史特拉第瓦里”的音色，再加上具有绝对音感天才歌手的歌声。但是，就在音乐会活动日开始之前，陆续发生多起可疑事件。然而就在活动当天，柯南一行人所在的音乐会会场突然发生大爆炸。没多久，整个会场就被浓烈的火海所包围…。

第14弹围绕柯南和基德展开。大富豪铃木次郎吉向基德发出了挑战书，在飞往大阪的机上放了稀有宝石，他并未打算让基德得逞，柯南等人也一同被邀请前去。以天空为舞台的头脑风暴即将上演，《天空的遇难船》将呈现！r

毛利侦探事务所突然接到一通威胁电话。之后，路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了！“蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……”根据犯人寄来的挑战书，若不能解读谜之暗号，便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和毛利兰在米花市内来回奔走，却完全找不到破解暗号的方法。另一方面，此时的江户川 柯南与灰原和少年侦探团一起，沉浸在观看最爱的足球比赛的快乐之中。正当比赛渐入佳境之时，从兰打来的电话那里，柯南得知了威胁电话的事情。柯南为了解读暗号独自一人离开赛场，却得知了无人能够阻止的恐怖事实……

怪盗基德再度发出预告信，目标竟然是俄罗斯-罗曼诺夫王朝的皇室秘宝“记忆彩蛋”。柯南与服部联合保护“记忆彩蛋”，但把作案时间推理错误，令基德得逞，但基德于逃走中途被狙击。 自此引出一连串疑问，名侦探柯南，将于大阪解开一连串事件。