游城十代在前往决斗学院实技测验的途中，偶遇了传说中的决斗者武藤游戏，并从他手中获得一张幸运卡“天使小精灵”。与此同时，一个名为七星的神秘团体出现了，它的目的是夺取被封印在决斗学院地底遗迹中拥有毁灭世界力量的三幻魔。游城十代及大德寺老师等人被选为遗迹的守护者，与七星展开了黑暗决斗。后来众人意外发现大德寺老师也是七星的成员之一，十代打败大德寺老师，彻底挫败了七星的阴谋，并得到贤者之石的卡片。三幻魔事件结束后，原来的伙伴们相继离开决斗学院，一众新生入学。游城十代受到“光之波动”的影响，无法进行卡牌决斗。之后，游

21世纪初，人类将多数人留在被哥斯拉蹂躏的地球上，仅使被选中的人们乘上恒星间移民船·阿拉特拉姆，前往能够移居的“约定之地·τ星e”。但这一计划失败，人类只得再度返回地球。而长距离亚空间航行所引发的时空歪曲，导致人类回到的地方变成了“两万年后的地球”。在这个地球，主人公·晴男等人在遭受哥斯拉袭击的同时，与埃克西弗、比尔沙尔德两种族的异星人共同实行谋划了20年的“对哥斯拉战术”，通过殊死战斗成功击倒了哥斯拉。

1945年8月9日，美国向日本投下原子弹。就读医科大的青年浩二（二宫和也 饰）在毫无征兆的情况下死于非命。转眼三年过去，浩二的母亲福原伸子（吉永小百合 饰）似乎渐渐承认了儿子已不在人间的事实，她的丈夫、两个儿子皆已逝去，孤身一人在信仰的支撑下走过艰苦岁月。在某个夜晚，浩二突然在母亲身边现身。伸子喜出望外，和儿子热烈交谈。浩二不改善谈的个性，与妈妈有说有笑，当然他盘桓人间还有一个理由，那就是记挂情投意合的未婚妻佐多町子（黑木华 饰）。町子而今在某个小学担任教员，她念念不忘浩二，为此耽搁了自己的婚事。　　死去

诚人（松田龙平 饰）是一名在边缘挣扎的摄影师，有一天，他收到前女友静流（广末凉子 饰）的来信，信中说自己要在纽约开摄影展了。　　回忆的匣子打开了，三年前大学里两人的故事从一个美丽的橘子开始，两人的分裂却源于静流叫诚人教她摄影，原本只是单纯想融入诚人的世界的静流却显示出极高的天赋，迅速在摄影比赛中捧回新人奖，这让诚人心生嫉妒，进而提出分手，静流说会等他有一天成为一名专业的摄影师再和他见面。　　时光荏苒，两人未曾有过任何联系，可是同学会上竟传来静流早就在一年前死去的消息。诚人无法相信这是真的，他登上了飞往纽约

春野一家人住在宁静祥和的小山村，他们的生活恬淡幸福，不过家族成员却各有各的烦恼。祖父（我修院達也 饰）性格古怪，行为乖张，醉心于私动画的制作；父亲（三浦友和 饰）是一位驻家催眠治疗师，他专心工作，无暇他顾；妻子美子（手塚理美 饰）总算暂时从育子的繁忙生活中解脱出来，于是决定重拾餐桌卡的绘画工作。夫妻俩鲜少交流，隔阂暗生；就读中学的长子阿一（佐藤貴広 饰）恋上新来的转校生，他徘徊犹豫，始终不敢表达；刚上小学的女儿幸子（坂野真弥 饰）总以为自己的头颅在不断变大，这个奇怪的幻想让她倍感困扰。　　吊儿郎当的叔叔（

江城日报主编白家三小姐白云柔因家族生意而不得已与陆家军少帅联姻，白云柔在周旋于感情与事业的过程中发生了一系列啼笑皆非的故事。

林九妮和夏安琪是从小到大的好友、大学同窗，她们毕业后同时进入一家大型外企乐易网工作，并受到位高权重的副总裁杨欣君的赏识。杨欣君觊觎林九妮的青春美貌，企图利用手中职权加薪、升职等好处来收买她。老实本分的林九妮断然拒绝，而心思复杂的夏安琪则选择了投怀送抱。很快林九妮就因自己的不识时务遭到了一连串的打击报复，忍无可忍的林九妮选择拿起法律的武器向法院起诉，并得到了著名律师白杨的鼎力帮助。最终，林九妮打赢了官司，也证明了自己的清白，而夏安琪付出了惨重的代价，杨欣君也受到了法律的制裁，正义得到了伸张。

参与了戊戌变法的举人易君恕仓惶出逃，束手就擒之际，被英国牧师林若翰搭救，入住香港翰园林若翰家中。林养女倚阑是中国海员遗孤，养育成典型的英国淑女，受到香港绅士迟孟桓的追求。倚阑的傲慢与偏见使易君恕难以存身，他外出谋生遇挚友新安县举人邓伯雄，邓氏反对英夷拓界，决意死战，易、邓志同道合。邓伯雄为联合文氏大族抗英，娶文心瑜为妻。苦恋多年的海山堂主区眉娘虽五内俱焚，仍帮助邓购枪，不幸中了迟孟桓和香港警察梅轩利的圈套，被火烧毁容颜。林若翰密友－－香港辅政司骆克熟悉中国文化，与总督卜力在新租借地拓界上所施手段不同，被警

在冲绳合宿中，在由于朝阳的云隙光而达到了最高氛围值的桥上，雪村和冰室进行了理论值最高的亲吻，但由于采集的唾液量并不充足，于是决定再次测量。为拜访唾液检测的专家，一行人动身前往理工部生命科学学院。而他们面前出现的是花魁打扮配一袭白衣的艳丽女子翠雨，以及她的恋人克里斯。雪村邀请翠雨二人帮助他们一起完成「证明喜欢的实验」，却因此见识了翠雨他们压倒性的爱之气场……

此次故事的舞台在伦敦。鲁邦这次的目标是一幅画，上面有着暗中操控英国政府的神秘组织·渡鸦所暗藏的宝藏的线索。面前的阻碍是苏格兰场、军情六处。还有察觉到鲁邦行动而出现的钱形警官。而鲁邦面前的那位侦探——竟然是夏洛克·福尔摩斯！