在另一时空，索伦博士正阴谋毁灭星球，攻击进取号。唯一能够帮助新舰长皮卡德来阻止索伦的，只有销声匿迹了78年的柯克船长。

一艘巨大的外星无人探测器向地球航来，它不断地发出奇特的电波信号：功率强大的信号煮沸了海水，干扰了附近的星舰并造成了广泛的破坏。此时，詹姆斯·柯克中将与他的船员们在完成了让史波克上校复活的任务后，驾驶着从克林贡人那抢来的赏金号从瓦肯星返航，尽管他们已经知道了将面临军事法庭的指控：他们被指控盗窃了联邦星舰进取号，并对她的毁坏负有责任...

星际联邦的大敌克林贡帝国因为连年争战，经济及生态环境破坏殆尽，一位克林贡领袖遂在进取号星舰的护送下前往地球谈和，中途却遭到阴谋份子暗杀，并且嫁祸进取号…

2285年，在与可汗的战斗中损坏的联邦星舰进取号，返回了地球的太空港以进行维修。柯克还在为史波克的死感到悲伤。麦考伊医生出现了种种异常的行为：如擅自闯入被封锁的史波克原来的舱房、胡言乱语等，最后他被送进了医院进行精神检查...

邪恶的可汗逃脱十五年前被柯克船长拘禁的星球，他本人是一位智勇双全的领袖，但此刻已变成一个邪恶的狂人，他誓言要向柯克船长讨回血仇。于是他先劫持了一艘联邦战舰，后又偷取了柯克船长的儿子和旧情人制造的毁灭性武器。并引诱进取号投入他精心设计的圈套…

一位女主播溺水身亡，嫌疑落到了她的姐姐身上...

加州海岸一直都存在着两只巨大史前海洋生物，他们为了取得海洋的霸主地位而争斗了数百年，直到有一天他们被冰河所冻结。近年来，随着气温的升高，这两只史前生物又复活了，他们在海洋中依然为所欲为，人类的生存受到了威胁，人类必须要解决这样的危机，一场人与史前生物的惨烈争斗开始了。

二战时期，一批美国战俘被关押在德军的监狱里，故事就发生在17号监狱。有两名囚犯想要越狱，却被德军所杀，监狱里的囚犯们开始怀疑他们其中有人出卖了他们。大家都把嫌疑集中在一个人身上——狡猾的Sefton（威廉·霍尔登 饰）身上。Sefton虽然也是个囚犯，但他靠组织“赛马”、卖酒还有出租望远镜赚了不少钱。不久，一位美国中尉被抓进狱中。他在法兰克福火车站制造了爆炸案炸死了不少德军。然而此事随即被德军军官Oberst von Scherbach（奥托·普雷明格 Otto Preminger 饰）所获悉。

在地球生态已经遭到严重破坏、不适宜人类生存的未来时空，暴政官员德拉库特（朱迪·福斯特 饰）正勾结空间系统开发商，通过极乐空间的重启程序发动一场夺权政变；另一边，饱受辐射折磨只剩五天生命的工人麦克斯（马特·达蒙 饰），希望通过帮蛇头绑架富商获得偷渡极乐世界治疗的船票从而医治疾病。

1993年索马里战争，美国陆军因为情报错误而与索马里武装民兵进行持久的巷战过程，这只是由陆军游骑兵部队和三角洲部队及部分海豹突击队员共约150人于1小时内执行完毕的小任务，不料遭到当地军队的偷袭，竟演变成一场长达15小时的困兽之斗。