毛头小子竹本是美术系新生，对大学生活充满了憧憬，入驻公寓第一天便受到两个人的震撼：浑身裹着古怪艺术家气质的同屋森田，才华横溢而浑身萝莉气的自闭少女花本育，二人几乎同时喜欢上小育，但小育和美术老师阿修有亲戚关系，被他保护得非常严密。另一个室友真山被女生山田默默爱着，但他却痴迷打工时的上司——美丽成熟的建筑师理花。两条故事线交织着青春的一切：大学生活，艺术梦想，狂狷的内心，矛盾的感情。在身边人个个闪闪发光的映衬下，最为单纯平凡的竹本，从最初的迷茫慢慢意识到自己的成长……

小学生典道与佑价等同伴们就烟花升腾而起时是扁是圆展开争论，无果后，众人困惑起来，为了将困惑解决，他们决定趁夏季花火大会的机会去燃放烟花的灯塔上一探究竟。典道和佑价同时暗恋的同学，早熟的少女奈砂因为父母离异怀起心事。一场在典道和佑价之间进行的五十米游泳比赛结束后，奈砂单约胜利者佑价陪她去看烟花，不想对方最终决定同大伙一起去灯塔。奈砂最终拉上比赛失败的典道上路，目的地却变成了火车站甚至更远的东京。

在某街道的公園裡，3位飼養可愛柴犬的大叔：阿中爸爸、阿爺爸爸、幸子爸爸，他們總是聚在一起漫天閒聊，抱怨日常並順便遛著心愛的狗狗們，愛犬成痴的他們，連出門都要透過監視器與家裡的柴柴互動。

封印的卡片是《魔卡少女樱》又名《百变小樱》或《库洛魔法使》《CardCaptor Sakura》的第2部剧场版，第1部没有名字，大家公认为《香港之旅》。《封印的卡片》紧接在TV版70集后，是整个故事的大结局（不过后面还有一部同时上映的剧场版3，但与整个故事无关）

长野县的松本市，居住着平凡的高中女生高宫菜穗（土屋太凤 饰）。樱花烂漫的4月，菜穗迎来了二年级的开学典礼。谁知就在这一天，她收到了一封匪夷所思的信。寄信者居然自称是26岁的菜穗： “高二的我，不知一切可好。我在十年后的未来给你写了这封信。如果要问，为什么要写给十年前的你，那是因为现在的我有许多追悔莫及的往事。我期待着你能收获诸多的喜悦和幸福，并且不会错过生命中那些重要的人和事。因此希望你不要重蹈覆辙，我会在这封信中将接下来发生的事，以及届时希望你能够选择的路告诉你。”

有一天众多企业在米花市政大楼，共同进行了一种新的游戏“茧”的成果发表会。玩家可透过这个游戏，进入虚拟世界中，体验实地游玩游戏的快感。r但是在这个同时，汤玛斯辛多拉董事长基于某些动机，杀害了工藤优作的朋友樫村忠彬，后来被揭发罪行。r在另外一边正式启动的“茧”，被泽田弘树所开发的诺亚方舟程式入侵，使整个游戏变成了一场生存游戏。眼看着未出局的人数越来越少，柯南如何挽救50个人的性命呢？......

一个女人来到小五郎处，请其帮助看守宝石。这女人名叫牧树里，是代表着日本的女演员。她收到预告称有人将会去夺取她所拥有的宝石“命运的宝石”，而预告者正是怪盗基德。小五郎断言：基德将会在树里担任主角的传统话剧的公演最后一天前来盗宝。于是第二天，柯南，小五郎，小兰还有少年侦探团一起前往传统话剧公演的东京汐留。柯南对小五郎的推理充满疑问，于是自己推理基德的出现。然而，在那里出现的竟是工藤新一！

毛利侦探事务所突然接到一通威胁电话。之后，路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了！“蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……”根据犯人寄来的挑战书，若不能解读谜之暗号，便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和毛利兰在米花市内来回奔走，却完全找不到破解暗号的方法。另一方面，此时的江户川 柯南与灰原和少年侦探团一起，沉浸在观看最爱的足球比赛的快乐之中。正当比赛渐入佳境之时，从兰打来的电话那里，柯南得知了威胁电话的事情。柯南为了解读暗号独自一人离开赛场，却得知了无人能够阻止的恐怖事实……

目暮警官、小兰的母亲妃英理、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑。

柯南用新一的身份在电话不自愿地约会了小兰，陪她看5月3日的午夜场电影，以便请求小兰替他参加森谷帝二教授举办的茶会。柯南为此十分烦恼，不知如何掩饰他变小的事实。r柯南目送小兰离开后，为此烦恼的柯南接到一个电话，是来历不明的炸弹客挑战柯南！少年侦探团收到的引爆遥控飞机、被安装了炸弹的装小猫的篮子，还有环状线的的炸弹陷阱，大家奋力推理，才及时预防了可能发生的意外。可是，最后发现被安装了炸弹的其实是工藤新一和小兰的约会地点－米花町大楼！柯南该怎么办呢？.......