警察无法完全应对的世界规模治安危机，导致了一种新职业——武侦的出现。武侦，即在法律框架内(不排除少数例外)，解决个人或组织的委托，弥补警察的不足，维护社会和平的武装侦探。而本故事，就发生在那样一个时代的武侦培养学园——东京武侦高。　　一直向往普通人的平静生活，期望尽快从东京武侦高转走的少年——远山金次，有个自初中(神奈川武侦高附属中学)毕业后一直隐藏的秘密。然而，渴望平静的他，却在一场骇人的自行车劫持事件中，邂逅了自此将改变他人生轨迹的人物——神崎·H·亚里亚。 　　金次的秘密究竟是什么？神崎·H·亚

由“黑色”裁决“黑色”——德国，加拿大，以及（英国）伦敦。黑衣组织所制造的暗杀案件在世界各地接连发生！目标的共同点是？组织的目的是？不久，琴酒就将魔爪伸向日本。这场暗杀大戏不过才刚刚开始。宿命的相遇，突然——东都水族馆进行了大规模翻新。为了观赏那里的特色——世界第一个二轮式巨大摩天轮而来到此处的柯南一行人与那里一位受伤的神秘女性相遇。她似乎由于某种原因丧失了记忆。线索只有已损坏的手机。柯南与少年侦探团一起，决定帮助她找回记忆。这时，灰原觉察到了异样。这个女性，是左右眼颜色不同的“双色瞳”的拥有者。

天地混乱的时代，人类与妖怪共同和平地居住在这片大地上，这个地方，就叫作"桃源乡"，是文明与信仰的发源地。现在，这个世界正在发生可怕的异变，妖怪们因为牛魔王复活试验产生出的负面波动而狂暴起来，向人类发动袭击。桃源乡面临着重大的危机。于是，玄奘三藏受命与孙悟空、猪八戒、沙悟净三人一起前往天竺国，去阻止这个试验，将妖怪的善良本性唤回，解救桃源乡的人们。

外星人的祖先在三亿年前生活在地球上，后来因为环境恶化而被逼迁往另一星球，但那里的环境原来比地球更糟，他们想返回地球，却无能为力，现在他们当中有几个人来到地球，打算消灭人类，让同胞迁回地球。“猫猫咖啡屋”的主人白金棱和友人赤坂圭一郎为了阻止外星人的行动，展开“猫猫计划”，把Red Data Animals的DNA注入五个女孩体内，使得她们在变身后有神奇的力量对抗外星人。五个女孩组成“东京猫猫”，跟外星人战斗，为地球的未来而努力。猫猫咖啡屋是棱和圭一郎的基地，以咖啡屋作掩饰，东京猫猫的女孩平日在那里兼职侍应，

室内足球风靡世界十几年后——。日本也诞生了许多明星选手，不论男女老少，室内足球在日本掀起了热潮大和晴看过U18世界杯决赛后，为日本代表队球员天王寺刻成的表现所吸引，怀抱着对成为天王寺一般的球员的向往，开始了室内足球生涯。他在恒阳学园高中室内足球部与队友们相遇，面对阻挡在前的劲敌们，朝着梦想奋力拼搏！为室内足球赌上了一切属于男高中生们的“现在这一瞬间”，开幕——！

人类在遇到小行星撞击的天灾后，旧大陆因为种种原因，成了无法居住的区域。因此，人类迁移到了在小行星后，从海底变成了陆地的陆地、“海陆”居住。但是同时出现的“忍”，却又让人类面临了绝望的边缘。受到“忍”的侵袭的伊势城危在旦夕，身为姫巫女，同时也是雨的母亲，在最后一刻将雨托付给了三田。年幼的雨，曾经从伊势的学者月读口中，得知了存在于旧大陆，传说中能够打倒“忍”的机神·奇加罗德的存在，因此在离开伊势后，便与三田等人一同寻找着前往旧大陆的方法。在旅行的途中，小雨等人遇上了一个被“忍”袭击的村庄。在击退忍的同时，遇上

曾经在日本被烧毁的梵高名画《向日葵》在聚集了大富豪的纽约拍卖会场中标。铃木次郎吉以3亿美元的史上最高金额得到了这幅名画，他的目的是收集散布在世界上的7幅《向日葵》。前所未有的大规模展会在以拥有铁壁般的安全系统著称的日本美术馆雷克洛克举办，这一梦幻般的新闻发布至全世界，柯南和兰也关注了新闻转播。次郎吉打算召集通称为“七武士”的专家来保护《向日葵》，但此时怪盗基德突然现身，在发出宣战布告声称自己必定要夺取这幅名画之后便离去。本应该只以巨大宝石为目标的基德为何要夺取这幅画？在下一个瞬间，高中生侦探工藤新一的身影

平凡的地球少女京乃圆是一名发自内心喜爱故乡千叶县鸭川的大海的女子高中生她创立了「如果遇到有困难的人，就会伸出援助之手帮助他人」为中心、并且只有她一个部员的「鸭女Jersey部」，是一个现在依旧充满元气进行社团活动的17岁少女。　　某日，圆遇见了一位来自外星的谜之少女兰，一见到她时就觉得很志同道合，便热情邀请她加入Jersey部，因为意想不到能成功招进新部员，圆感到十分高兴。不仅如此，圆的班级里有一名不可思议的转校生麦波，同样来自外星但与兰阵营完全不同的少女麦波也加入了Jersey部。原先只有圆一个人的鸭女

本作品舞台设定于前作一万二千年后的世界。作为普通市民的阿玛塔‧空，在播放《Aquaria舞动于空》的戏院中遇到看一次就迷上电影的御子乃‧铃白，二人后来亦因为这个话题而开始到城中闲逛。这时候，Altair界向他们生活的城镇进行两年来几乎没有停过的攻击，不同的是今次出现了新型Abductor，令人类一方——由圣天使学园学生操控的机械天使Aquaria没法招架。战火很快波及到刚刚认识的二人，阿玛塔在危急关头使用身体潜在的Element能力飞走，却又突然被Aquaria系统选中为Vector Z驾驶员……终焉所引

薄雾笼罩的京都，一起攸关日本国家安全的大事件即将发生。一艘疑似装载爆炸物的可疑船只靠近舞鹤湾。通过对船上相关数据和零部件的勘察判明，该船很大可能来自海外。此消息一出，立刻引起全日本上下的恐慌。就在同一天，江户川柯南、毛利小五郎、毛利兰以及少年侦探团的各位一同观摩海上自卫队组织的对空作战演习，他们史无前例地登上了宙斯盾舰穗高号，与全国各地聚集来的孩子们一起，被装备了电子武装的高科技宙斯盾舰带来的巨大魄力所震撼。谁知演习中突发意外，原本虚拟的作战瞬间变成真枪实弹的杀戮。不久，海面上漂浮着的失去左臂的自卫队队员