双亲很早就过世了，水原凉带着妹妹明钟住在简朴的公寓中。　　突然有一天，从天而降一位神秘的美少女益田西守歌，她率领着一个黑衣军团，自称是水原凉的未婚妻。　　而水原凉却不愿意接受这个事实，于是，一幕幕让人啼笑皆非的故事就此展开……

艾尔巴的角色埃文斯被描述为“恶性自恋”，为引起女性的注意“不惜使用暴力”，申请保释被驳回后，他从押解车中逃出，来到昔日恋人家中报仇。报仇完毕，又在一片漆黑的雨夜，出现在了泰瑞家门口。泰瑞有两个孩子，丈夫外出未归，她好心想借电话给埃文斯一用，却不料让自己和孩子都陷入了险境之中。

在遥远的未来，海贼船是一种被认可的私掠船。在这样的时代中，女高中生茉莉香一边在参与宇宙巡航部的活动，一边在咖啡厅打工。某天，一对男女突然出现在她的面前，自称是茉莉香已逝的父亲的部下，邀请她担任宇宙海贼船“弁天号”的船长。根据在一个世纪前的独立战争中发行的“私掠船只执照”，失去了船长的海贼船，其继承权将由船长的直系子孙获得。踏入无法预料的新生活的茉莉香，在前方等待她的究竟是……

本作的舞台是活跃着怪盗与侦探的近未来架空世界里的“侦探之都横浜”。世界上有着被称为“TOYS”的特殊能力，侦探与怪盗之间使用“TOYS”能力相互战斗着，这个时期被称为“大侦探时代”。作品讲述的是在二十一世纪这个“大侦探时代”中，以侦都横浜为舞台，4名立志成为名侦探的少女与曾经是侦探的青年的故事。

为了寻找能够代替在上一次战斗中失去了的“ 光之剑”的武器，莉娜与高里再一次踏上了旅途。在途中遇见了为了作掉海贼而造访露维纳刚鲁多王国的阿美利亚与吉路刚帝士，虽然为老朋友间的再会而感到喜悦，但是、在他们面前出现了的露维纳刚鲁多王国的监察者——特务搜查官，一个被称为瓦依扎的男人。他的想法与行动让莉娜感到愕然……

距今约300年前，江户时代初期的剑客——柳生十兵卫，他的弟子小田豪鲤之介协助将“心形眼罩”传给第2代柳生十兵卫。而成为第2代柳生十兵卫的条件是“水汪汪的、柔柔嫩嫩的、肉肉的”(ぽちゃぽちゃのぷりんぷりんのぼんぼーん)。 300年后的今日。一名典型的女中学生——菜之花自由，在鲤之介眼中具备“水汪汪的、柔柔嫩嫩的、肉肉的”之特质。菜之花自由载上次眼罩后并能变身为天下无双的剑客“柳生十兵卫”第2代，并且以剑道和平消除龙乘寺家族对柳生家族的怨恨，此亦是第2代柳生十兵卫心形眼罩的秘密所在。

五十年前发生“王国战争”。掌管这世界的邪恶魔石，拥有威胁全人类的“DB”（DARK BRING），在五十年后的今再次的苏醒。唯一能对抗他的希望，就是那位万中选一，可以使用圣石“RAVE”的少年哈鲁。而他那意外地找到，像雪人一般的可爱小东西普鲁，展开一场救世之路。

能够透视人梦境深处这种不可思议能力的高中生藤原梦路，有一天遇到了与从“幻界”徘徊到“现界”的少女——玛利！玛利究竟是什么人？幻界是什么地方？梦魔又是什么东西？还有，梦魔们到底是为了什么来到人间界？从梦中的世界来到现实世界的少女玛利，与能够透视梦境的少年梦路，二人交汇之时，“梦”与“现实”即开始交织在了一起，能碰撞出温暖的火花吗…… 以梦境与现实的交界为舞台，两人与梦魔间的战斗即将开始。

故事的舞台是海岸边上的楢崎町，在这个小镇上有两种超常现象，其中之一是永恒存在的彩虹，还有一个就是被称为“Gift”的魔法，它可以实现这个镇上的原住民的一个愿望。有一天，曾经和主人公一起在小镇上生活过的义妹“莉子”又回来了。然后主人公和青梅竹马的“雾乃”之间的关系发生了诸多变化。这一游戏的推广使日本美少女游戏业得到了一定程度上的发展。

《侦探歌剧：少女福尔摩斯》以架空的怪盗和侦探活跃的近未来为背景。在这个世界里存在着有被叫做“Toys”的特殊能力的人类。利用这种特殊的能力，“侦探”和“怪盗”争斗不断。而故事就是以将来要成为侦探的四个少女夏洛克、妮洛、艾露克露、柯蒂妮娅为中心展开的。