故事的主人公是喜欢魔法的高中生黒羽快斗，他的父亲是在8年前因事故而死亡的大魔法师·黒羽盗一。某日，他在房间一栋隐秘门中发现传说中的怪盗基德的衣服，于是他打算会见基德。在那里，他遇到了父亲过去的同伴·寺井，并得知父亲就是怪盗基德，而且死因不是事故死而是他杀。于是，快斗为查出杀害父亲的犯人，而自己成为了基德。本作和《名侦探柯南》有不少共通点。例如怪盗基德在两作中均有出现、迷之组织的登场、主人公真正身份不被世人所知，等等，感觉就像是融合了魔法元素的柯南。

故事的主人公是喜欢魔法的高中生黒羽快斗，他的父亲是在8年前因事故而死亡的大魔法师·黒羽盗一。某日，他在房间一栋隐秘门中发现传说中的怪盗基德的衣服，于是他打算会见基德。在那里，他遇到了父亲过去的同伴·寺井，并得知父亲就是怪盗基德，而且死因不是事故死而是他杀。于是，快斗为查出杀害父亲的犯人，而自己成为了基德。本作和《名侦探柯南》有不少共通点。例如怪盗基德在两作中均有出现、迷之组织的登场、主人公真正身份不被世人所知，等等，感觉就像是融合了魔法元素的柯南。

　　拥有“平成鲁邦”之称的怪盗基德，无论防备多么严密的钻石珠宝对他来说都易如反掌。他一直是中森银三等警官的梦魇，而关于他的身份却始终是个谜。某高中二年级学生黑羽快斗，是一个出身于魔术世家的俊朗男孩，他与青梅竹马的女孩中森青子终日打情骂俏，乐在其中，也由此惹出了诸多的麻烦。偶然机会，他在父亲黑羽盗一的画像后面发现一间密室，在这里不仅发现了各种精密的设备，也发现8年前因事故去世的父亲竟和基德有着千丝万缕的关系。数日后，消失多年的怪盗基德发出预告，将要盗取东京市美术馆的宝石月之瞳。警察与盗贼新的战争就此展开……

宇宙世纪0071年。脱离SIDE 3，慕佐自治共和国后3年。吉翁‧兹姆‧戴肯的遗孤卡斯巴尔跟阿尔黛西亚兄妹，与金巴‧拉尔一起逃往地球，并寄住在提亚波罗‧玛斯家中，与爱德华、雪拉过着平稳的日子。而一直追踪他们的扎比家的魔手，悄悄地再次逼近…。此时，SIDE 3将国名更改为吉翁自治共和国。扎比家不但掌握实权，整个支配体制也日渐巩固，更开始着手开发对抗地球联邦军的最新兵器－机动工兵。

当有什么东西达到“100”的时候，就会爆发的少年·路人（龙套）。外表极其普通——不如说是不起眼。不擅长迎合气氛的他，实际上拥有着强力的超能力。盯上了这样的他的能力，而接连现身的伪灵能力者以及宗教团体、不良头头、谜之秘密组织……。在追求普通青春的龙套之处，平稳的日子究竟会不会到来？

平凡的中学二年级少年影山茂夫，因其微弱的存在感与名字茂夫的谐音被周遭人称为龙套（モブ），但不起眼的他其实是强大的天生超能力者。历经每一次的成长，龙套开始认为自己的超能力是危险的存在，为了不让超能力失控，龙套无意识的压抑著情感。虽然只想平凡的度过每一天，但各种麻烦却接二连三找上他，随着被压抑的情感在内心一点点膨胀，龙套体内积累的力量似乎也正蠢蠢欲动......

六条壬晴是个对周遭的人、事、物都漠不关心的少年，但他的体内却隐藏着忍者的世界「隐世」最强的秘术「森罗万象」。为了夺取这种无与伦比的力量，源自伊贺忍者的“灰狼众”全体出动，誓言要将壬晴带回伊贺之里。另一方面，壬晴的英语教师云平与壬晴的同学虹一都是万天之里的忍者，他们的任务就是保护壬晴的安全。一场「森罗万象」的争夺战将各方忍者卷入其中，壬晴若想恢复独善其身的生活，唯一的办法就是成为隐之王。于是他被迫走进隐世，迎向未知的挑战……

日本有間獨一無二的聖誕老人公司。他們夏天作襪子、冬天則送禮物給孩子們。

【本片翻译由澄空学园字幕组提供】故事讲述的是从东京都西部被分割出来的这座都市中，“超能力开发”被列为学校课程的一部分（学生作为人体科学实验对象）。在二百三十万人口中，有八成都是学生，所以被称为学园都市。他们每天都在超能力开发上进行相互竞争。根据能力高低不同，可以分为6级，从无能力（level 0）到超能力（level 5）。故事的主角上条当麻是学园里的一个无能力者，但并非完全没有能力，他的能力是能够将一切异能之力无效化。他只有右手能够使用这种能力，还给自己的这种连上帝的奇迹都能抹杀的能力取名为“幻想杀手”

在第二次新吉翁战争、别名‘逆袭的夏亚’终结后，地球圈取得了短暂的和平。这之后3年，宇宙世纪0096年。在工业殖民地“工业7号”上进行了一项秘密交涉。和地球联邦政府有秘密协议，并依此发展的‘毕斯特财团’打算将过去用以威胁联邦的最高机密“拉普拉斯之盒”交给新吉翁的残党军“袖章”。另一方面，在亚纳海姆工业专门学校就读的少年巴纳吉·林克斯遇见了自称为奥黛丽·伯恩的少女。奥黛丽为了制止新的战争爆发，必须阻止“拉普拉斯之盒”的交易。巴纳吉在数次帮助奥黛丽之后，逐渐被她所吸引。随后，地球联邦察觉了这起交易，并进行军事介