以游戏第2作以后，准备转任法国巴黎的大神一郎回忆队员的往事。前4集每集各为一个小单元，最后两集为一个小单元。

《芯觉》是一部东方背景的异能战斗题材动画在一座名为“云城”的现代都市里，掌握元素之力的“先启司”守护着世界的和平。十年前的一场巨大变故，让“先启司”的势力逐渐式微，云城掌门人李尊元开始利用“芯石”进行人体改造，四分五裂的云城“先启司”陷入危机之中。记者岳骏天在采访途中不慎卷入到一场阴谋之中，而这场阴谋其实只是更大风暴的开端......

高中生无免偶然获得了一副戴上后无论做什么都会被人绝对认同的面具，然而即便如此他也没能鼓起勇气向暗恋的女生告白。直到发生那个将他的生活完全颠覆的事件……

只要登上塔，就能得到任何想要得东西。塔顶上有着这世界上的一切，登上塔顶的人可以主宰这个世界……甚至成为神。这是为了追逐星空而登塔的少女·蕾哈尔，以及只要有了蕾哈尔就什么也不需要了的少年·第二十五夜的，“完结”与“开始”的故事。

墨家子弟——墨小羽被制成秦俑封存千年，苏醒时来到了现代都市。这座充满欲望的城市，蛰伏着窥觊活俑的各方势力。秉持着墨家侠义的秦朝少年，又将在现代都市展开一段怎样的神奇旅程……

西域妖族少年撞上腹黑神秘的香料铺掌柜，是好心收留，还是另有目的？寻香之路上的各种怪谈奇遇，围绕两人展开……

全员小方脸演绎第五人格呆萌大乱斗，各色方言声优展示歇后语文学风。开始诡异中爆笑攻防逃解的乐趣吧！

萧炎得知异火线索后毅然深入塔戈尔沙漠，最终成功取得异火并与蛇人族女王美杜莎结下奇缘。随后萧炎勇赴三年之约，登上云岚宗击败纳兰嫣然一血前耻！不料异况突生，萧炎被人陷害被迫与云岚宗为敌，因此惨遭通缉不得不远赴迦南学院避难。萧炎在学院内与薰儿久别重逢，两人合力通过选拔进入内院，开始了全新的学习生活……

* 此篇乃是制作动画小组自行产出的剧情，并非原作者和月的构想。rr星霜篇故事发生于人诛篇约十多年后，晚年的剑心与神谷薰同患上不治之症，剑心在甲午战争（日本称为“日清战争”）时于中国失去记忆，最后左之助找到他并助他回到日本，最后剑心死于神谷薰的怀抱之中。故事前半主要以神谷薰的视点描述与剑心的往事，其间亦加插了少量人诛篇的回忆画面。

故事发生在维新政府建立之后的幕末时代。在一个小村庄里，生活着一位个性正直的少女神谷薰。村里有个名叫比留间五兵卫的男人，自称“拔刀斋”而到处作恶，阿薰为阻止五兵卫手持竹刀与之拼命，但却不是他的对手。五兵卫手起刀落，眼看阿薰性命难保，千钧一发之际，一位俊秀的红发剑士救下了她。 救下阿薰的剑心拿的是无法杀人的逆刃刀，却说自己就是杀人无数的“斩人拔刀斋”。阿薰对剑心产生了兴趣，她很想了解剑心的过去，想知道剑心为什么不再杀人，也希望剑心结束流浪生活，在自家的神谷道场安家，用剑去实现保护受苦受难之人的愿望……