该作是变形金刚系列新推出的动画作品，是一个面向低龄儿童的分支系列。

《变形金刚：领袖的挑战》是变形金刚系列动画的最新一季作品，讲述的是在《变形金刚：领袖之证》系列动画最后一战过去的数年后，已故擎天柱的灵魂突然显现并指引着大黄蜂从塞伯坦来到地球以迎接新一轮的挑战 : 艾之墓监狱舰在皇冠城附近坠毁，羁押着霸天虎囚犯的休眠舱四散各地的故事。本季动画片最大的亮点在于拥有众多粉丝的大黄蜂终于可以开口说话，并当上了领袖。

汽车人总司令官·擎天柱及领袖卫队和霸天虎的战斗还在持续着，因霸天虎科学参谋·震荡波的实验而被再现的远古塞博特恩生物：巨狰狞却发生了暴走，其中最为强悍的几只巨狰狞逃到了地球，虽然擎天柱等人历经艰辛终于封印了其中最强的恶鬼大帝·冲云霄，但却不得不回到和霸天虎的战场上，追击其余巨狰狞的任务就交给了被称为刀剑太保的两组新汽车人小队，他们从战国时代就沉睡在日本，现在将被人类的少年唤醒，阻止巨狰狞干部·四鬼众复活冲云霄的计划，保护具有神秘力量的传说之碟，并将全部的巨狰狞再度封印。

五个汽车人军团中负责维修的汽车人机器人(擎天柱、大黄蜂、救护车、警车及隔板)找到了传说中的能量火种源，因而被牵涉到一场汽车人及霸天虎之间的大战。这场太空大战令到这五个汽车人被泄留在22世纪中期的底特律。在地球上认识了一个叫做莎莉桑达克的人类。

400万年前，为了逃离战乱连年的塞博坦星，被称为“微型金刚”的小型变形金刚种族驾驶宇宙船飞离了星球，然而，他们的太空船穿越时空之后，却坠落在地球上。r400万年后，一位名为雷德的地球少年和同学们不经意在太空船中发现了其中一架微型金刚，微型金刚复活的讯号也在同时传到了汽车人和霸天虎手上，为了争夺微型金刚，两军前往地球，并且继续在塞博坦星的战争......r

军方和汽车人的秘密合作计划面临被取消的危险，而重新复活的威震天和红蜘蛛引领霸天虎军队，密谋夺取能量源，企图在地球掀起又一场腥风血雨。此时主人公萨姆告别相恋的女友米凯拉，要开始自己梦寐以求的大学生活了，但一切似乎都不那么顺利，一块小小的魔方碎片似乎在给予萨姆某种启示。为了获取魔方里的信息，霸天虎开始了对萨姆的追击，擎天柱为了保护萨姆而牺牲，萨姆受其感召，决定重新担负起自己的使命。

军方和汽车人的秘密合作计划面临被取消的危险，而重新复活的威震天和红蜘蛛引领霸天虎军队，密谋夺取能量源，企图在地球掀起又一场腥风血雨。此时山姆（希亚·拉博夫 饰）告别相恋的女友米凯拉（梅根·福克斯 饰），要开始自己梦寐以求的大学生活了，但一切似乎都不那么顺利，一块小小的魔方碎片似乎在给予山姆某种启示。为了获取魔方里的信息，霸天虎开始了对他的追击。擎天柱为了保护山姆而牺牲，受其感召，他决定重新担负起自己的使命。