令世间万物为之恐惧的魔王被击败，在这个时代，人们再也不必担心灭亡。在能够对未来抱有幻想的今天、少女被卷入了蛮横的暴力纠纷中。美丽的景色已荡然无存，城市和花草树木都陷入火海。耳边伴随着活生生被解体的挚友悲痛的临终哀嚎，少女逃出生天。最令人绝望的事情，莫过于至亲之人逝去之时，自己仅能袖手旁观。然而，少女面前出现了一位剑士。他仅用一击便轻松斩断了这份绝望以及少女无法抗衡的那份蛮横。“本大爷叫柳生宗次郎，是这地球上最后的柳生后裔。”在这世界上有这样一群人，他们站在各个力量的顶点之上，并冠以“最强”之名。剑士也是这

千年后再度回归的彗星造访地球的一个月前，日本深山的某个乡下小镇。女高中生三叶每天都过着忧郁的生活，而她烦恼的不光有担任镇长的父亲所举行的选举运动，还有家传神社的古老习俗。三叶身居这小镇之中，又处于过多在意周围人目光的年龄，因此对大都市的憧憬日益强烈。然而某一天，自己做了一个变成男孩子的梦。这儿有着陌生的房间、陌生的朋友。而眼前出现的则是东京的街道。三叶虽然感到困惑，但是能够来到朝思暮想的都市生活，让她觉得神清气爽。另一方面在东京生活的男高中生立花泷也做了个奇怪的梦。他在一个从未去过的深山小镇中，变成了女高

精灵宝可梦，简称宝可梦，是栖息于这颗星球的奇妙生物。天空、大海、森林、城市，全世界的每一个角落都能看到它们的身影。故事的主角是两位少年，目标在宝可梦对战中成为最强的小智，和梦想收服所有宝可梦的小豪。小智的搭档是皮卡丘，小豪的搭档是炎兔儿，他们将和许许多多的宝可梦一起，在广阔的宝可梦世界展开冒险。开始逐梦和冒险之旅吧！朝着宝可梦的世界！出发！