剑悟变成特利迦奥特曼，为了守护大家的笑容，在永恒核心里消失了。时间推进到特利迦消失的两年后，时冈代理队长率领精英胜利队想方设法复活在永恒核心中消失的真中剑悟。在众人的不懈努力下，终于复活了剑悟。剑悟复活后取回了特利迦的力量，结果在面对新的怪兽时，陷入了苦战。就在特利迦难以招架的时候，泽塔奥特曼跨越宇宙次元，再次来到地球前来帮助特利迦。没想到随着事情的发展，遥辉发现了事情的背后居然浮现出了宿敌赛雷布洛的影子。于是，遥辉开始追查赛雷布洛的踪迹。三千万年前超古代人的残党，他与赛雷布洛联手，试图获取剑悟的光之力量

特利迦奥特曼与黑暗巨人的战斗结束数年之后，地球再次迎来了和平的年代。现在已经基本见不到怪兽的踪影了，怪兽带来的灾害影响也已经渐渐地淡出了人们的视线。人类已经开辟了火星移居地，并打算组建新的队伍开辟第二个火星移居地。地球上的人类开始了探索宇宙的征程，现在进入了新领域时代。结果，在探索的过程中，宇宙神秘生命体斯非亚突然出现在了主人公明日见奏大所在的小队面前。斯菲亚对地球发起了侵略，并断绝地球和宇宙的一切通讯，地球变成了“孤岛行星”。奏大原本在宇宙港送货，结果却遇到了斯菲亚的袭击。奏大为了掩护其他人逃走陷入了死

高中生鬼头遥香原本是一个人气漫画家，然而有一天她的代表作《初恋英雄》却突然被外界判定为抄袭，自此她的漫画连载被中止，人气也一落千丈，甚至同班同学都对她避之不及。同一天，她意外获得了一副不可思议的墨镜，戴上墨镜的她变得能够分辨出混在人类中的怪人，还能莫名其妙地变身并和怪人战斗。一个神秘男人通过这副墨镜联系上她，告诉她只要找到桃井太郎并向他宣誓忠诚，就能夺回失去的东西。于是鬼头遥香踏上了寻找桃井太郎的路程，并在途中结识了和她有相似遭遇的猿原真一、犬冢翼、雉野刚三人。

本作讲述了各位假面骑士参与游戏，在竞争与合作中不断进步，最终取得胜利的故事。主人公是神秘的青年——浮世英寿,而另一位角色樱井景和则是一个热心善良，为人正直的好青年。这一天，樱井景和前去参加面试，他表达了自己当志愿者的意向，并说出了自己这几年做过的诸如捡垃圾、支援灾区、捐款还有献血等各种事情，然而面试还是失败了。网络红人鞍马祢音直播表示自己要过普通人的生活，但她和景和却突然被卷入一场意外，遭到攻击。幸好被豪德寺、吾妻道长、与英寿救下，祢音与景和从他们的口中了解到世界即将毁灭，而众人都身处一场大型游戏之中。这

两位特殊部队的队员坐在运输机内，盯着监控的屏幕。突然一声警报响起，系统检测到有怪兽出现。这时候特殊部队队员比留间弦人下达了新的指令，弦人命令所有人按照预案去指定地点集合。一头来自宇宙的怪兽甲壳怪兽从天而降，巨大的冲击力给城市带来了很大的破坏。地面防卫部队与怪兽展开了激烈交战。怪兽的肆意破坏摧毁了很多大楼，怪兽出现的地方化为了一片火海。弦人为了拯救还没有逃出的群众，独自冲入火海救人。弦人在救人过程中出现意外，关键时刻他体内涌现出一道神秘的光。新的奥特曼就此诞生了，新的奥特曼不光救下了弦人队长，还打败了怪兽。

高円寺让在整理搬家物品时，打开了爷爷留下来的旧物，无意间唤醒了B系列机器人卡布达，并由此得知，地球上有13个被称为“和平星”的东西，找到它们并聚集在一起，就能为人类带来希望与理想，同时，每个和平星都能实现一个愿望。于是，小让与卡布达踏上了寻找和平星的道路，并结识了金龟次郎、田德丽娜、丸子龙等另外几只爷爷制作的B系列机器人伙伴，一起与邪恶的B系列机器人蟑螂恶霸3人组展开了“和平星争夺战”……